Rsa97

https://dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/encryption...

Если вы делаете коннект к БД в каждой функции, то результат логичен. Коннект занимает в лучшем случае 0.2-0.5 секунды, в худшем - несколько секунд.
Используйте внедрение зависимости, подключайтесь к базе один раз с начале скрипта и передавайте подключение в экземпляр класса при его создании. Или по старинке используйте синглтон.

JOIN с нужным условием.

MySQL не умеет работать с JSON-файлами.
Так что получайте данные из MySQL, формируйте нужную структуру и записывайте в файл средствами PHP.

Вообще-то ошибка показывает на совершенно другую проблему.
В вашем коде:

FROM " . DB_PREFIX . "product_to_category ptc LEFT JOIN  . DB_PREFIX . "category_description"

Тот же фрагмент в тексте ошибки:

FROM oc_product_to_category ptcoc_category_description

Куда делся LEFT JOIN oc_?

А проблема с пустым $product_id решается элементарно. Достаточно предварительно проверять переменную и заменять её на фиктивное значение, например -1.

DEPENDENT SUBQUERY - это очень плохо. Это значит, что подзапрос вызывается заново для каждой строки из основной таблицы.

SELECT `ebids`.*, IFNULL(`c`.`qqq`, 0) AS `has_qqq_comment`,
       IFNULL(`c`.`www`, 0) AS `has_www_comment`, IFNULL(`c`.`eee`, 0) AS `has_eee_comment`
  FROM `ebids`
  LEFT JOIN (
    SELECT `item_id`, SUM(`itemtype` = 'qqq') AS 'qqq',
           SUM(`itemtype` = 'www') AS 'www', SUM(`itemtype` = 'eee') AS 'eee'
      FROM `comment_system`
      GROUP BY `item_id`
  ) AS `c` ON `c`.`item_id` = `ebids`.`id`
  WHERE `ebids`.`status` != 'auto'
  ORDER BY `ebids`.`id` DESC
  LIMIT 0, 100

`carts_goods` (`cart_id`, `goods_id`, `quantity`, `price`)

JOIN - это не объединение, а декартово произведение (с фильтрацией по ON).
Для объединения используется UNION.

SELECT `ID`
  FROM `table1`
UNION ALL SELECT `ID`
  FROM `table2`

SELECT `p`.*,
       COUNT(`op`.`id`) AS `ordersCount`,
       IFNULL(SUM(`op`.`count`), 0) AS `countOrdersCount`
       IFNULL(SUM(`op`.`price` * `op`.`count`), 0) AS `ordersSum`
  FROM `products` AS `p`
  LEFT JOIN `orders_products` AS `op` ON `op`.`item_id` = `p`.`id`
  LEFT JOIN `orders` AS `o` ON `o`.`id` = `op`.`order_id`
    AND `o`.`date` > '2020-01-01'
    AND `o`.`status` != 2
  WHERE `p`.`active` = '1' 
  GROUP BY `p`.`id`
  ORDER BY `p`.`id` DESC
  LIMIT 0, 25

year - ключевое слово MySQL. Либо меняйте название столбца, либо берите название в обратные апострофы: `year`.

Используйте штатное партицирование MySQL.
https://dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/partitioni...

Возможно ли в mysql составить так чтобы узнать пользователей одного чата?

Возможно.

Как правильно составить sql запрос?

Через JOIN.

SELECT `p`.`id_user`, `u`.`name`, `u`.`surname`, `u`.`avatar`, `p`.`chat_id`
  FROM `party` AS `o`
  JOIN `party` AS `p`
    ON `o`.`id_user` = :user
      AND `p`.`chat_id` = `o`.`chat_id`
      AND `p`.`id_user` != :user
  JOIN `users` AS `u` ON `users`.`id_user` = `p`.`id_user`