Rsa97

Делать два JOIN'а:

SELECT IFNULL(`f`.`name`, `ft`.`from_n`) AS `from`, 
       IFNULL(`t`.`name`, `ft`.`to_n`) AS`to`
  FROM `transfer` AS `ft`
  LEFT JOIN `name` AS `f` ON `f`.`xml` = `ft`.`from_n`
  LEFT JOIN `name` AS `t` ON `t`.`xml` = `ft`.`to_n`

COUNT()

Вообще, для такой задачи есть устоявшаяся схема:

categories (id, name) - категории (отечественный, зарубежный и т.д.)
items (id, category_id, базовый набор атрибутов) - в вашем случае авторы
attributes (id, name, type, ...) - возможные атрибуты
categories_attributes (category_id, attribute_id) - атрибуты, допустимые для категории
items_attributes (item_id, attribute_id, value) - собственно значения атрибутов

Такая схема легко расширяется, может содержать дополнительную информацию - признак обязательности атрибута в описании, список допустимых значений атрибута для типов "один из списка", "несколько из списка", единицы измерения и т.д.

WHERE IF (`set_time_in` > `set_time_out`, 
          `set_time_in` <= CURTIME() OR `set_time_out` >= CURTIME(),
          `set_time_in` <= CURTIME() AND `set_time_out` >= CURTIME())

При динамическом наборе переменных - только сначала считывать список имён переменных, затем строить запрос вида

SELECT `t`.`ID`, `t1`.`VALUE`, `t2`.`VALUE`, ..., `tN`.`VALUE`, `t`.`TIME`
  FROM (
    SELECT DISTINCT `ID`, `TIME`
      FROM `testtable` 
  ) AS `t`
  LEFT JOIN `testtable` AS `t1` ON `t1`.`NAME` = :name1 
    AND `t1`.`ID` = `t`.`ID` AND `t1`.`TIME` = `t`.`time` 
  LEFT JOIN `testtable` AS `t2` ON `t2`.`NAME` = :name2
    AND `t2`.`ID` = `t`.`ID` AND `t2`.`TIME` = `t`.`time`
  ...
  LEFT JOIN `testtable` AS `tN` ON `tN`.`NAME` = :nameN
    AND `tN`.`ID` = `t`.`ID` AND `tN`.`TIME` = `t`.`time`

Если в процедуре нужно построчно обходить результат выборки, то придётся использовать курсор

СREATE PROCEDURE curdemo()
BEGIN
  DECLARE done INT DEFAULT FALSE;
  DECLARE a CHAR(16);
  DECLARE b INT;

  DECLARE cur CURSOR FOR SELECT id, data FROM t1;
  DECLARE CONTINUE HANDLER FOR NOT FOUND SET done = TRUE;

  OPEN cur;
  read_loop: LOOP
    FETCH cur INTO a, b;
    IF done THEN
      LEAVE read_loop;
    END IF;
    здесь выполняются нужные действия
  END LOOP;

  CLOSE cur;
END

SELECT `value`
  FROM `table`
  WHERE `post_id` IN (98, 54)
  GROUP BY `value`
  HAVING COUNT(*) > 1

DELETE `p`.* 
  FROM (
    SELECT `FIO_ID` FROM `Phone` GROUP BY `FIO_ID` HAVING COUNT(*) > 1
  ) AS `p1` 
  JOIN `Phone` AS `p` ON `p`.`FIO_ID` = `p1`.`FIO_ID` AND `p`.`Number` = :phoneNumber

Либо ставить триггер BEFORE DELETE, выдающий исключение при попытке удаления.

RTFM
CONVERT() и CAST() используют свои обозначения для типов.
У CONVERT() другое количество аргументов и другой их порядок.
CONVERT(`date`, CHAR(10)) или CAST(`date` AS CHAR(10))
Ну и, возможно вам больше подойдёт стандартная DATE(`date`)

А зачем для этого процедура? Достаточно обычного запроса
И зачем возвращать из запроса названия организации и сервиса, если их туда только что передали?

SELECT `os`.`service_cost`
  FROM `Org_services` AS `os`
  JOIN `Organizations` AS `o` ON `o`.`ID` = `os`.`org_id` AND `o`.`org_name` = :orgName
  JOIN `Services_list` AS `s` ON `s`.`ID` = `os`.`service_id` AND `s`.`service_name` = :servName

А на кой нужен такой изврат? Не проще ли прямо в php-скрипте получать данные из MySQL?

Смотря что нужно. Если весы подключены к клиентскому компьютеру, то нужен плагин к браузеру или отдельный локальный мини-сервер, у которого можно будет запросить данные. Если можно подключить к основному серверу, напрямую или через COM-to-Ethernet, то из PHP можно работать с COM-портом.
Протокол обмена с весами надо искать в документации на конкретную модель.