Rou1997

Что угодно означать может, у меня часто не запускается, если просто окно в свернутом состоянии, смотрите логи.

На что стоит обратить внимание

На то, на что нагрузка выше при работе с IDE, именно эту деталь надо апгрейдить в первую очередь

Layout на тот момент просто еще не загружен, надо это в самом Fragment делать, в onCreateView, после inflate.

runOnUiThread.

Именно, что "как то", и судя по вопросу, вам это не нужно, и под Linux в любом случае будет заточено, потому что Android на уровне C++ - это и есть Linux, так что осваивайтесь, но повторюсь, сперва объясните зачем.

Можно подправить, если по новой поставить слушатели и т.п., но все получится в кучу, поэтому концепция плохая, один класс - один layout, так что делаете либо 2 фрагмента, либо 2 активности.

Пишите сразу в байт-коде! И не HEX, а нулями и единичками!
Нет никаких самоучителей, на smali не пишут приложений, только редактируют, а для этого, если у вас развито мышление аналитического типа, достаточно спецификации с опкодами (командами) и метода научного тыка, а если не развито, то со временем разовьется, но долгое время будет очень тяжело, оно вам точно надо?

Каких именно действий? adb недостаточно?
В бесплатной версии Genymotion этого нет? В пиратских тоже?
Если нигде нет, тогда "велосипед" пишите.

по поводу написания снифера сети(понял что пока не по силе)

Нет там ничего особо сложного, можно декомпилировать, дизассемблировать существующие, что тоже способствует глубокому изучению Java, Dalvik, Android.

для самой OS такие как отслеживание процессов системы

Диспетчер задач, как в Windows: список процессов, сколько каждый занимает ОЗУ и процессорного времени и т.п., какого общая загрузка процессора, сети и т.п.

Всё некак немогу прийти к выводу что подойдёт..

Это к преподавателям вопрос, вообще для учебы обычно осваивают более широкие темы, такие как базы данных, сети.

Игру проще сделать на готовом игровом "движке", таком, как Unity.

и как быть с PHP ведь там все обращения к Mysql , как-то заменять на js?

Конечно, не надо заменять, сервер с PHP и MySQL оставьте в интернете, а приложение пусть будет клиентской частью, как веб-интерфейс в браузере.

phonegap

Phonegap как раз позволяет наиболее легким быстрым способом отделить веб-интерфейс (HTML & CSS & JS) и "вынести" его в приложение, самый простой способ, не считая варианта в приложение вставить "движок" (WebKit), то есть просто открывать сайт в приложении.

Это называется "обработать клик по элементу" (для Гугла: "android java listview on item click"), а не "сделать активным" и не "выделить", сайт Климова вам в помощь, там есть пример.

Именно по типу Yii - нет, то есть нет фреймворка для той же "родной" Java и тех же IDE, есть отдельные нестандартные библиотеки, а из фреймворков только Xamarin, PhoneGap и т.п., их авторы "замахнулись" на создание еще и своей IDE, языка, и т.п., в итоге у каждого продукта узкий круг задач.

В каждой строчке - 2 textView и картинка.

Каким образом это сделано?

Как управлять этими картинками из кода по-отдельности для каждой строки списка

Считается, что должна быть Model (класс с 2 String и 1 полем с изображением) и ViewModel (Adapter с массивом или списком моделей), и элемент списка как View для каждой Model, программно обращаться надо через Adapter, но вообще весь этот "строгий" MV* не обязателен, всегда можно обойтись без лишних классов, то есть "сделать в лоб", тогда структура приложения может стать хуже, зато проще и быстрее, для "времянок" самое то.

Попробуйте "посниффать", и в коде страницы Google Play покопаться, суть в том, чтобы "прикинуться" мобильным клиентом, идентификатор - это всего лишь аккаунт.

Конечно, Fragment, если "slide", то еще и со "скроллом", какие тут много Activity, а еще посмотрите, нет ли в вашей IDE готового шаблона проекта с такой навигацией.

Неужели android sdk настолько богат и хорош, что разработчики не пытаются изобрести абстракцию уровнем выше для решения повторяющихся и рутинных задач?

Конечно, нет, например, он совершенно не рассчитан на RAD (Rapid Application Development). Но я мог бы сказать вам, что он богат и хорош, что "это норма" (c), и вы бы поверили на слово!
Вот и им так сказали (Sun/Oracle, потом Google, JetBrains), в то же время задач, требующих этого RAD, перед ними никто не ставит, либо нужно самому додуматься и еще и руководителя в этом убедить, либо RAD действительно не нужен для данной задачи, не всем же иметь ограниченный бюджет и сроки.

Как быть?

Нужно исходить из рентабельности, для себя и для взломщиков, как выше сказали, любая защита "ломается", разница только в приложенном усилии и времени, а это уже вопрос бюджета, нужно сделать так, чтобы работа взломщика стоила столько, чтобы ее не оплатили, в то же время ваша работа по защите тоже не обошлась вам слишком дорого.