Работа комплексная, можно обратиться к какому нибудь интегратору типа софтлайна, крока, техносерва и тд.
Во первых можно запросить грубое КП по ТЗ, иногда делают бесплатно.
Продают и ПО и железо - может выйти дешевле розницы. При желании сами соберут, настроят и ЛВС проведут.
Даже если почти наугад выбирать оборудование и лицензии из поисковой выдачи - получается внушительно.

1. Для стойки предусмотрите вертикальные кабельные организаторы, горизонтальные тоже сойдут.
   
2. Посмотрите в сторону модульных патч-панелей. Дозабивать обычные, когда они уже в эксплуатации, то еще удовольствие.
   
3. На счет АТС действительно лучше сразу присмотреться к IP-ATS, например что нибудь от Yeastar.
   
4. Возьмите сразу два ИБП. Один блок питагия сервера в ИБП1, второй в ИБП2. Резервация+упрощение обслуживания.Если есть средства, то лучше on-line ИБП, автоматически решится вопрос со стабилизацией напряжения, раз у вас есть проблемы.
   
5. Составте схему сети, заведите кабельный журнал и промаркируйте все, что можно.
   

Способ 1 - Установите ПО из под дефолтовой администраторской УЗ, если она не отключена.
Способ 2 - Пробросьте "наружу" VPN.Настройте на удаленном пк через тот же TeamVIewer VPN и подключитесь по нему.Пропишите на удаленном пк маршрут до DC в вашей сети и установите ПО из под своей доменной УЗ. После чего удалите маршрут.
Способ 3 - Пробросьте "наружу" VPN.Настройте на удаленном пк через тот же TeamVIewer VPN и подключитесь по нему.Пропишите на удаленном пк маршрут до DC в вашей сети. Из под дефолтовой администраторской УЗ\своей доменной УЗ запустите консоль и добавьте УЗ пользователя в локальную группу администраторов. Устанавливаете ПО из под его УЗ.