Пробуйте драйвер подключения диска поменять со scsi на virtio
Еще вариант пробросить usb port напрямую в truenas и посмотреть как он его определит, слишком много уровней абстракций, и может глючить или много накладных расходов при переходе между ними
По wifi если есть возможность отключить авто переключения между сетями 2,4 и 5 ГГЦ. 2,4 может быть перегружен "соседями" до полной неработоспособности
Ну и еще один момент, раид всегда работает со скоростью самого медленного диска, пробуйте поочередно каждый диск протестировать на скорость записи(просто тест скорости в виндовс без рейда сравнивать с рейдом не совсем правильно)
Mini-ITX платы со встроенным процессором в районе 7-10к- за эту цену i3 или i5 5 или 6 поколения. Ну такое.
А зачем NAS держать на столе? Смысл сетевого хранилища как раз в том, что его можно воткнуть куда угодно, где оно не будет мешаться.
Ну, в таком случае будьте готовы страдать и дальше с этим USB.