PresetX

Как сказал none7, в конфиге прописываешь и os prober сохраняется. Чтобы убедиться, при update-grub должна высвечиваться винда после линуксов.
Если память не изменяет, достаточно иметь два разных раздела под efi, и в /etc/fstab проверить, чтобы монтировался нужный /boot, тогда виндовый загрузчик точно не перезапишется, и его можно будет выбрать через биос.
Ну и его легко восстановить через diskpart и bcdboot, если только он пострадал.

Временное решение - кастом табы типа nightTab. Постоянное - флаги хрома (не нашел), смена поисковой системы (не пробовал) или расковыривание/откат/какие-то билды.

Если собираетесь ставить плагин, не забудьте ему в сведениях включить режим инкогнито, чтобы не сталкиваться в нем с Алисой.

А может вашу задачу можно решить в разы проще, и обычным CreateFile с флагом OPEN_EXISTING запрашивать монопольный доступ? Наверное в случае уже открытого дескриптора просто вернется ERROR_SHARING_VIOLATION