Брать надо то, что умеете готовить. Я пытался на TrueNAS настроить так, чтобы в одной папке подпапки были видны только определенным пользователям. Не вышло. В Синолоджи это делается за минуту в свойствах папки.
Попробовать установку на своем компе ручками через msiexec (вроде так зовется).
Попробовать прописать в GPO: Computer Configuration > Policies > Administrative Templates > Windows Components> Window Installer > Always install with elevated privileges
Ну и как вариант обратиться в поддержку 1С.
Вы даже не указали, какую ошибку выдаёт МФУ. Куда отправляются сканы? Виндовая шара? Линуксовая? NAS?
Ваш вопрос из серии "У меня в подвале что-то стучит".