CPU от Intel Xeon E3-1230 можно версию от 1220, 1225, но она без гипера, дешевле i7-го, но по производительности не уступает, тем более в виртуализации
Материнку на свой вкус, есть негласное правило по стоимости она должна быть не больше стоимости проца и сразу рассмотреть с аппаратным рэйдом, сча таких вагон/ ASRock Z97
По охлаждению: тихость водянки это миф, нагрузку дашь - либо пойдет на взлет, либо сгорит все. Пока что лучше воздуха нету и выбор большой. Ставь нормальный корпус в сеточными фильтрами. К примеру CM Storm Trooper или что нить посерьезнее, при моих 5 кулерах в корпусе и один на проце Cooler Master V6, тишина, в твоем случае кулер от Noctua NH-D14 . Все корпусное управляется подобием реобаса на корпусе.
БП либо модульный с управлением либо наполовину, в любом случае при таком выборе они будут очень тихие(бесшумные). к примеру Corsair RM850 или Corsair CS750M
По пункту чтоб без тормозов:
1. если на линукс, то програмный рэйд + SSD диск(и) для кеширования
2. заюзать рэйд аппаратный, если будет куплена такая мать + SSD кеширование
3. забыть на понты с ssd кэшированием, и просто собрать raid 5,6 или самое оптимальное для виртуализации 10 вот так: 1х128Гб SSD для системы + 4х2Тб Raid10 - Мега быстро, мега надежно