Есть более легкий способ?
Увы нет. Для подсчета сколько уже оплачено можно использовать счета, но в любом случае без rest (в случае облака) или php (в случае коробки) не обойтись.
То, что вы называете "частичной оплатой" в битриксе существует только в разрезе заказа в интернет-магазине.
