Я стараюсь от sudo держаться подальше, если речь не идёт об инсталляции ПО. Был печальный опыт на заре карьеры, с чужими скриптами. Собственно, что в Windows, что в Linux — работать надо только из-под пользователя, а sudo и рут приберечь для особых случаев.