alovanton: у вас платные плагины, идущие в комплекте с темой не могут достучаться до обновлений, потому и получается, что обновления ступорятся. Если просто зайдете в пункт "плагины" и будете тыкать в обновления по одному (плагины которые бесплатные и из центрального репозитория вордпресс) то они обновятся.
alovanton: An error occurred while installing WPBakery Visual Composer - вот именно поэтому я и заподозрил что это приобретено странным путем, и все же это не отменяет того, что проблема как раз в visual composer. Думаю, если попробуете его отключить и после проверить обновления - все заработает.
И гляньте содержимое файла /js_composer/include/classes/updaters/class-vc-updating-manager.php
Если плагин достался вместе с темой - его могли просто пропатчить так, что он не достучится до обновлений. Еще должно сработать обновление плагинов по одному. Извините что заподозрил в незаконном добывании - на моей практике не один случай был, когда халявно добытые решения содержали в себе шелл или еще что-то
https://codex.wordpress.org/Nginx
не очень состыковывается с вашим
try_files $uri =404;
fastcgi_split_path_info ^(.+\.php)(/.+)$;