Melkij

http_build_query(array_combine($arr1, $arr2))

Так удалили его уже давным давно.
Вот, аж в 5.4.0 уже удалили: php.net/manual/en/ini.core.php#ini.register-globals

это urlencoded-текст в кодировке UTF-8.

Берите выше. Это один целый JSON. JSON таким же образом кодирует не ASCII символы. После json_decode никакого urldecode делать уже не нужно.

Но, когда картинка всего одна, то в FILE_VALUE хранится сразу массив

Нормальное решение - поправить вот эту логику заполнения.
Если должна быть коллекция - значит должна быть коллекция. И пофиг, из десяти, одного элемента или вовсе пустая.

И указанный выше цикл дает неожиданный результат

Хочу напомнить, что даже PHP 5.4 живёт последние 10 дней. Обновляйте PHP.
Я всё-таки надеюсь, что вы даже не пытаетесь что-то разрабатывать с выключенным выводом ошибок. А начиная с 5.4.0 обращение к строке как массиву по строковому ключу провоцирует E_WARNING. Но первый байт (по нулевому смещению. т.е.) при этом всё ещё выводится.

Значит запрос вернул 0 строк.
print_r(false) ничего не выводит, поэтому лучше пользоваться var_dump

php.net/manual/en/security.magicquotes.disabling.php

$str = preg_replace("~href='(?!/(?:af|zh|ru)/)([^']+)~","href='/ru$1", $str);

?

Подождать PHP7. Уже недолго осталось.
Под виндой и PHP 5.x невозможно. Там int всегда 32-битный.

Другие варианты:
- классическая большая математика: bcmath, GMP
- поставить в виртуалку нормальный *nix и работать там. Под никсами int собирается 64-битный.

Приджойнить таблицу дважды, но с разными алиасами.

select tt.name, tf.name 
from table2 
join table1 tt on tt.id=toID
join table1 tf on tf.id=fromID

Полезно читать документацию целиком, а не до интересующего места:

Только для MySQL Native Driver