Дерево плохой шумоизолятор, нужны плотные плоды дерева или многослойные ДСП. Тонкая фанерка низкочастотные шумы кулеров никак не заглушит.
Охлаждение прямотоком не получится, я читал что надо пробовать строить сложный лабиринт в воздушном канале, как я понял результат нулевой. Это значит нужен посредник, например металлический радиатор снаружи или даже весь корпус металлический толстые стенки, при необходимости закрепить радиаторы как внутри так и снаружи и пустить дополнительные циркуляции чтобы проходили внутри по стенкам . Больше пары киловатт так не отвести, точнее зависит от размера.
Хорошо решением бесшумной сборки может стать жидкостное охлаждение, начиная с блока питания. Жёсткие диски в теории можно в отдельный бокс засунуть, их проще охлаждать