Сам работаю с микроконтроллерами и пару лет назад так же столкнулся с задачей поиска толковых обучающих материалов. Вот несколько советов (разумеется, субъективных) на этот счёт:
1. Большая часть книг в стиле "Разработка встраиваемых приложений" или "Пишем на ассемблере под PIC" - пустая трата времени. Не то что бы они совсем бесполезны, но зачастую они сильно устарели, а информация в них избыточна и излишне детализирована. Я не нашёл ни единой книги, которую не захотелось бы забросить после пары десятков страниц.
2. Я очень рекомендую цикл статей
"AVR. Учебный курс" на сайте easyelectronics.ru. Там и железо, и ассемблер, и регистры - простым и доступным языком. Очень рекомендую, даже если работаешь не с AVR. Там изложены основные принципы и самих контроллеров и периферии - то, с чем каждый день сталкиваешься в реальных проектах.
3. Без знания C в микроконтроллерах - никуда, поэтому рекомендую книгу Кернигана и Ритчи -
"ANSI C". Это и учебник, и справочник под одной обложкой. Рассказывается всё просто, кратко и без лишних рассусоливаний.
4. В качестве дальнейшего вектора развития я бы рекомендовал углубиться в железо, чтобы понимать, с чем работают твои контроллеры. Книги
"Искусство схемотехники" и
"Что нужно знать цифровому инженеру об аналоговой электронике" станут хорошим выбором.
5. Не ограничивайся только книгами. Сейчас доступно множество открытых онлайн-курсов о встраиваемых системах на любой вкус. Это потрясающая форма обучения, которая совмещает в себе текстовый материал, видеолекции и практические лабораторные работы. Минус - всё это удовольствие на английском языке. Пожалуй, лучший пример, это
Embedded Systems - Shape The World - встраиваемые системы - от самых азов, до ретро-игр на контроллере. В комплекте дают доступ к хорошему интерактивному учебнику C. Прекрасный курс с упором на практическую составляющую. Сессия совсем скоро завершится, но доступ к видеоматериалам ещё должен остаться.