Может быть я ошибаюсь конечно, но реально не проще взять 1С? В вашем случае не шибко дорого будет.
Дистрибутивы под linux есть (как клиент, так и сервер при необходимости), можно подобрать конфигурацию под себя, легко масштабируется, распространенная (программистов под 1с достаточно много, как и материала в сети), легкий для понимания встроенный процедурный язык, универсальная.

Тоже был против внедрения 1С в компании, правда у нас масштаб крупнее (ИМ) - бухгалтер настояла. Теперь работаю и радуюсь. Нет необходимости придумывать свой велосипед, а все доработки в основном исключительно косметические - для быстрого доступа к функционалу. Ошибок в коде минимум. А со своим велосипедом можно мучаться бесконечно.

UPD: Также не забывайте про безопасность, в которой вы можете накосячить, нормативно-правовую базу, которая в стране у нас меняется с первой космической скоростью и новые протоколы онлайн касс (а 1С под все это затачивается с обновлениями) и так далее.

UPD: Ах да, не забывайте, что Python не шибко быстрый из-за того, что интерпретируемый.

Можно просто поставить скрипт который вызывает setTimeout с нужной функцией после загрузки сайта. Если необходимо выполнять только при переходе по определенной ссылке, то дописываешь к ссылке что то вида yousite.com/?startscript и проверяешь в этом скрипте через window.location адрес и ищешь есть ли там этот флаг (startscript).

т.е. например ссылка на страницу https://yousite.com/hellowworld?startscript

На странице код вроде такого:

function func() {
  if (window.location.search.indexOf("startscript") != -1)
    console.log('Script start')
}

setTimeout(func, 5000);

Попробуй использовать модуль threading для данных целей. У меня в большинстве случаев он закрывает все вопросы по многопоточности.