Сама процедура активации программной лицензии на сервер 1С:Предприятие ничем не отличается от активации клиентских лицензий. Советую гайд
Пошаговая инструкция по активации лицензии 1С:Пред....
А вот где активировать лицензию, тут да, могут быть вопросы.
Стандартно серверную лицензию надо активировать непосредственно на машине с сервером 1С:Предприятие (есть ещё такая штука, как отдельный сервер лицензирования, но про него лучше отдельный вопрос задавать).
А вот с активацией клиентских лицензий возможны варианты в зависимости от подключения, типа клиентского приложения и пр.
Например:
1. Если машина с сервером 1С одновременно является терминальным сервером и клиенты подключаются по RDP, то в любом случае все лицензии активировать на этой машине и в зависимости от потребности можно вкл/выкл раздачу лицензий сервером 1С (учитываем, что сервер раздаёт лицензии на каждый запуск, а если лицензию клиент получает сам, то на терминальную сессию, в рамках которой можно запустить несколько баз используя только одну лицензию).
2. Если терминальный сервер и сервер 1С:Предприятия на разных машинах, то активировать можно и там и там. Если клиентские лицензии активировать на терминальном сервере, то интереснее подсчёт лицензий при работе с несколькими базами, но если есть веб-клиенты, которые будут работать браузером, то они в этом случае получить лицензию не смогут. Если активировать на машине с сервером 1С, то получить лицензию от сервера смогут любые клиенты, но лицензия сервером выдаётся на каждый запуск (сеанс).
3. Если терминального сервера нет, юзеры подключаются толстым/тонким клиентом 1С, то можно активировать одну многопользовательскую лицензию на машине с сервером 1С или однопользовательские на каждом из клиентских ПК. В первом случае лицензии будут выдаваться сервером на каждый запуск (сеанс) и можно будет запустить только SQL базы на этом сервере, а файловые базы клиенты запускать не смогут. Во втором случае лицензии на ПК, на котором с одной лицензией можно будет запустить несколько баз, причём как SQL, так и файловых, как на сервере, так и локально, но на каждый ПК однопользовательскую лицензию надо будет активировать отдельно, а потом при каждом изменении параметров ПК восстанавливать - не каждого админа порадует такая перспектива.
4. Если база опубликована на веб-сервере и клиенты подключаются по http(s) веб-браузером, то активировать клиентские лицензии можно только на машине с сервером 1С и принять то, что лицензии будут выдаваться на каждый запуск (сеанс).
Возможны ещё множество других сценариев и сочетаний способов подключения, для каждого из которых нужно будет отдельно подумать, где и как активировать клиентские лицензии.
Если есть вопросы по вашему случаю, то спрашивайте, постараюсь ответить.
P. S.
Есть ещё такая штука, как Сервер лицензирования 1С, который можно поднять на отдельной машине, но если будет только один сервер 1С и параметры машины, на которой будет он установлен, не будут меняться динамически, то лучше обойтись без этого.
