Если карта создана через ЯндексAPI, то удалить все элементы управления можно двумя способами.
Первый способ - при создании карты в разделе установки параметров есть массив "controls". В нем должен быть перечислен список необходимых объектов управления. Если оставить его пустым, то карта инициализируется без элементов управления.

// Инициализация карты
var myMap = new ymaps.Map('map', {
    center: [50.45754, 30.453987],
    zoom: 10,
    controls: []
  });

Второй способ - если карта уже создана, то можно отключать ненужные элементы управления следующим образом:

// Инициализация карты
var myMap = new ymaps.Map('map', {
    center: [50.45754, 30.453987],
    zoom: 10
  });

    // Удаление стандартного набора кнопок
    myMap.controls.remove("mapTools")
    .remove("typeSelector")
    .remove("searchControl")
    .remove("trafficControl")
    .remove("miniMap")
    .remove("scaleLine")
    .remove("routeEditor")
    .remove("smallZoomControl");

Узнать названия всех доступных элементов управления можно вот здесь.

Если в результате вы готовы получить не массив объектов, а объект с объектами, то могу предложить следующий вариант решения вашей задачи:

var itemsResult = {};
	items = document.querySelectorAll('.item');
	
	for (var i = 0; i < items.length; i++) 
	{
		var currUID = items[i].dataset.service_model+items[i].dataset.service_id;
		
		if (typeof(itemsResult[currUID]) == 'object')
		{
			itemsResult[currUID].count++;
		}
		else
		{
			itemsResult[currUID] = 
			{  
				"service_model": items[i].dataset.service_model, 
				"service_id": items[i].dataset.service_id, 
				"count": 1
			};
		}
	}