Если карта создана через ЯндексAPI, то удалить все элементы управления можно двумя способами.
Первый способ - при создании карты в разделе установки параметров есть массив "controls". В нем должен быть перечислен список необходимых объектов управления. Если оставить его пустым, то карта инициализируется без элементов управления.
// Инициализация карты
var myMap = new ymaps.Map('map', {
center: [50.45754, 30.453987],
zoom: 10,
controls: []
});
Второй способ - если карта уже создана, то можно отключать ненужные элементы управления следующим образом:
// Инициализация карты
var myMap = new ymaps.Map('map', {
center: [50.45754, 30.453987],
zoom: 10
});
// Удаление стандартного набора кнопок
myMap.controls.remove("mapTools")
.remove("typeSelector")
.remove("searchControl")
.remove("trafficControl")
.remove("miniMap")
.remove("scaleLine")
.remove("routeEditor")
.remove("smallZoomControl");
Узнать названия всех доступных элементов управления можно
вот здесь. 
