Как грамотно организовать JS код в ООП стиле разнесенный по файлам?

Нету!

class App {
    constructor() {
        this.app = document.querySelector('#city');
    }

    init() {

    }
}

замените на

class App {
 function app () {...}
}

Как грамотно организовать JS код в ООП стиле разнесенный по файлам?

Потому, что у объекта, генерируемого конструктором, нет свойства app.

Как правильно вставить массив JSON в функцию?

Не может быть, я же в коде указал - console.log('data = ', data);
То есть, хоть какая-то запись быть должна. Или исключение выбрасывает предыдущий код, блокируя вывод в консоль. В любом случае, не видя конкретного сайта, помочь будет крайне затруднительно.

Как вручную включать или выключать скрипт в ячейках?

Делегирование событий.

Как нажать клавишу с помощью javascript?

click() ?

Снизить затраты производительности на работу с DOM таким методом возможно?

Don2Quixote, круто, но кулер на ноуте сразу ускорился при переходе на сайт =)

Как правильно вставить массив JSON в функцию?

Вы так и не ответили на мой вопрос. Что в консоли после вставки приведённого кода?
Если хотите продолжать его игнорировать и писать другие вещи - лучше тогда не отвечайте.

Снизить затраты производительности на работу с DOM таким методом возможно?

Да, ввиду всего сказанного выше, этот вариант будет чуть быстрее.

Как правильно вставить массив JSON в функцию?

Или дайте мне ссылку, я сам посмотрю.

Как правильно вставить массив JSON в функцию?

maiskiykot, вы мой ответ читали?

Все равно белый лист

-

тогда проверяйте , что в data приходит

А в коде я привел в нужном месте console.log('data = ', data);, чтобы вы могли посмотреть, что напишет консоль.

Как правильно вставить массив JSON в функцию?

maiskiykot, тогда проверяйте , что в data приходит, действительно ли массив?

window.addEvent('domready',function(){
	var request = new XMLHttpRequest();

	request.open('GET', 'eventFeed.php', true);

	request.onload = function () {
		// begin accessing JSON data here
		var data = JSON.parse(this.response);

		console.log('data = ', data);

		for (var i = 0; i < data.length; i++) {
			console.log(data[i].title + ' is a ' + data[i].start + '.');
		}

		new Calendar({
			calContainer:'calBody',
			newDate:'04/05/2018',
			cEvents: data
		});
	}
})

Как правильно вставить массив JSON в функцию?

maiskiykot, так и пусть себе выводится.
Когда идёт запрос серверу на получение данных? Можно его и отсылать по загрузке страницы:

window.addEvent('domready',function(){
	var request = new XMLHttpRequest();

	request.open('GET', 'eventFeed.php', true);

	request.onload = function () {
		// begin accessing JSON data here
		var data = JSON.parse(this.response);

		for (var i = 0; i < data.length; i++) {
			console.log(data[i].title + ' is a ' + data[i].start + '.');
		}

		new Calendar({
			calContainer:'calBody',
			newDate:'04/05/2018',
			cEvents: data
		});
	}
})

Как правильно вставить массив JSON в функцию?

maiskiykot, а на зачем он нужен? Ведь нужно вставить в конструктор ответ с сервера, следовательно, его и нужно отслеживать, а не загрузку DOM.

Как сделать так чтобы функция работала?

Для начала - нужно понять, где находится элемент с id=notesview и что он из себя представляет.

Как из двух массивов сделать массив с объектами?

AskJs, я тоже понять не могу, может, кто-то догадается =)

Как из двух массивов сделать массив с объектами?

AskJs, речь о массиве аа? Я же взял его из топика.
Если он пустой, то тогда меняются условия задачи.

Как из двух массивов сделать массив с объектами?

aa = ["a", "b", "c"];
	bb = ["1", "2", "3"];

	cc = aa.map(function(i, ind) {
		return {
			test : i.trim(),
			test2 : bb[ind].trim();
		}
	})
	console.log(cc);

Как из двух массивов сделать массив с объектами?

AskJs, а в чём вопрос? Пробелы?
Если в массиве строки - прогоните их через trim(), если числа - через parseFloat()
Или что-то ещё?

Как реализовать вращение ромба в пространстве с помощью кнопок?

Владислав, вы не поняли сути этого проекта. Тут подсказывают, отвечают на определённые вопросы и проч.
А готовый код пишут здесь - https://freelansim.ru.

Как реализовать вращение ромба в пространстве с помощью кнопок?

Владислав, так а в чём трудность? Пример я дал, нужно посидеть, его доработать под свои нужды. Что-то не выйдет - подскажем, но не писать же весь код за вас?
И не ромб это! Это частный случай параллелепипеда, называемый кубом.