Сайт буду просматривать пользователи, и делать всякое разное. он должен быть максимально быстрым.
Преждевременная оптимизация. Сайт для пользователя будет быстрым, если будут учтены все нюансы фронтенда (кеширование, минификация, спрайты, разные поддомены для ассетов...), а на сервере - правильно настроено кеширование и, где нужно, очереди.
Разделение на разные приложения - это просто часть архитектуры, которая не обязательно должна удовлетворять требованиям производительности.
Api будет выполнять ресурсоёмкие задания: вычисления, запись из бд в файл и наоборот, и прочие функции которые не выдержит сайт.
API не делает задания. А вычисления и запись из бд в файл - не являются ресурскоемкими операциями в общем случае. Да и сайт их обычно тоже не производит. В таком контексте сайт - это, скорее, фронтенд. А вычисления будут производиться на сервере.
Api обязательно должно быть многопоточным, ни об какой асинхронности речи идти не может, оно должно уметь обрабатывать много и сразу.
Тут вообще не понял. Многопоточность зависит от типа и настроек вебсервера (например, который стоит на nginx-ом). Чем не угодила асинхронность - тоже не понятно. И как она зависит с возможностью обрабатывать много и сразу - так же неясно. Очень упрощенно можно сказать, что с помощью асинхронности можно создать у пользователя впечатление, что сайт реагирует мгновенно (работает очень быстро)
Возможно, это все потому что 3 (4) часа ночи и вы переварили очень большой объем информации. Тогда попробуйте конкретизировать.
Если по существу:
1. Неважно, какой язык выбирать. Тот - который лучше всего знаешь. На любом языке можно реализовать что угодно. Большинство "производительности" достигается не за счет быстродействия стандартной библиотеки языка, а за счет кеширования, оптимизации sql запросов, настройки веб-сервера и базы данных и использования очередей.
2. Видимо, для вас важен вопрос: "Стоит ли разносить API сервера и клиент приложения на разные приложения, языки, инстансы?". Здесь ответить сразу не получится, потому что все зависит от задачи. Смотря как вы будете использовать свои инстансы. Какие вычисления будут проводиться и т.д. - больше конкретики по предметной области.