foreach($RU as $keyR => $valR){
if(isset($EN[$keyR]) && $EN[$keyR] !='' && preg_match('/^[a-zA-Z0-9:\s]+$/',$EN[$keyR])) $line = $line . '$wordbook["'.mb_strtolower(trim($EN[$keyR])).'"] = "'.trim(preg_replace('/[^a-zA-ZА-Яа-я0-9:\s]/u', '', strip_tags($valR))).'"; // '.$comment.'
';
}
Разбирайте структуру кода шаблона и поймете куда нужно вставить вывод.