Здравствуйте. Можете рассмотреть модуль интеграции с продуктом KernelCare от Cloudlinux, это программа, которая каждые часа ходит и проверяет наличие новых патчей, и устанавливает их автоматически. Так вы будете уверены, что ваша ОС имеет последние обновления, количество простоя сократится. https://www.ispsystem.ru/addons-modules/kernel-care

Также мы пишем подробную документацию, она по адресу https://docs.ispsystem.ru/ispmanager-lite
А если будут вопросы, то задавайте их из личного кабинета https://my.ispsystem.com, будем рады помочь :)