Fixid

Шифровать флешку. А лучше вобще не хранить код на ней.
Python скрипты очень сложно надежно спрятать.
Максимум что можно сделать, так использовать cython + .pyd

supervisor

А вы его нагрузили? CPU автоматически снижает частоту при простое

Для начала назовите модель материнки

Имеет смысл только если каждый поток почти не потребляет ресурсы и вы хотите утилизировать весь CPU

Загляните в /etc/hosts и config.php
Там тоже надо переименовать.
А по хорошему надо было использовать штатный функционал hostnamectl set-hostname 'newname'

На 256мб мне хватало на 20мб/с
у вас shared ip, что может вызвать небольшие проблемы в виде частой капчи

flask

Любой украинский хостинг

А как вы хотели? Грамотная настройка доступа не проста и уменьшает комфорт. От root работать можно, но слишком рискованно.
Когда надо запускайте команды через sudo

Попробуйте vlc, там кодеки частично интегрированны. Возможно проблемы с самим файлом

К сожалению просто ни как. Вам нужно или переиспользовать из некого пула или использовать единый для всех.
Варианты решения:
Запускать еще один скрипт который будет собирать/отдавать данные от остальных и записывать в базу через единственный коннект.
Нормально переписать скрипт на многопоточность
Использовать брокер очереди сообщений/Rabbitmq/redis pub/sub

p.s. нормальная базу спокойно держит не одну сотню соединений. Смотрите на ресурсы, если ещё есть то просто поднимите лимиты

4pda вас ждет, вы не первый. Там вам помогут намного быстрее

Смотря насколько важные данные там будут. Обычная флешка хороша для простого хранения, а вот ресурс записи обычно не высокий.
Если есть финансы, то ssd. Так будет быстрее и надежнее.