Сделайте так, чтобы левое меню было на 100% окна, а верхнее меню было слоем выше него (z-index: 5 или 9 или 100, на Ваше усмотрение).
Тогда при прокрутке верхнее меню уедет, а левое останется.
Это первое, что приходит в голову
во-первых блок со 100%-ной шириной лежит не внутри блока с фикс. шириной!
а дальше - смотря что Вам нужно:
*position:absolute - если блок НЕ фиксирован
*position:fixed - фиксированный блок
Все это относится к блоку с 100%-ной width
А так - все возможно с CSS
