Ниче непонятно. ВПН где запускаете? на клиенте или на сервере? какой протокол ВПНа ? если мы говорим про опенВПН \ WG то там можно настроить правильно маршрутизацию
Если ВПН запущен на сервере, то скорее всего никак...
Ну либо пробовать прописать статически DNS на микротике, с указанием site.ru >> 10.10.10.10