Drakosh

Ну так ты в цикл заносишь вывод на каждой итерации. Выноси за цикл.

let arr = [2, 55, 6, 65, 65, 65, 65, 65, 6, 4, 84, 5];
let result = 'Нет';
for(let i = 0; i < arr.length; i++){
  if (arr[i] == 5) result = 'Есть';
}
document.write(result);

Более короткий пример

let arr = [2, 55, 6, 65, 65, 65, 65, 65, 6, 4, 84, 5];
const result = arr.some(n => n === 5);
document.body.textContent = result ? 'Есть' : 'Нет';

Писать код так, чтобы он сам себя документировал.
Давать осмысленные имена переменным и функциям, пусть длиннее, зато читабельнее.
Почитать про архитектуру, паттерны.
Рекомендую "Чистый код" Р. Мартин. Там эта тема поднимается.