Со статьями проще, они копируются целиком (я в Evernote копирую) и достаточно помнить, что я про это читал и статью скопировал и в нужное время статья перечитывается.
Книги надо конспектировать. Да, это трудно. Но это необходимый труд. Конспекты -> Evernote. Хотя конспекты я предпочитаю хранить в OneNote.
Если книга читается по профдеятельности, то предлагаемый код нужно не открывать из приложенных к книге дисков/архивов, а набирать самому. Экспериментировать, изменять. Все эти наработки сохраняются в папочку на компе.
Не думайте, что у вас какая-то особенно плохая память. Нет, обычная, склонная запоминать только необходимое или произвёдшее сильное впечатление. Такая у большинства людей. Поэтому надо запоминанием материала надо работать. Людей, способных запомнить толстый справочник с одного прочтения и навсегда — единицы.