Дмитрий Энтелис

Никак. Эти метки отрисованы на слое стандартной карты, вы не можете их удалить.
Можно только переключаться между обычной/народной/спутником/гибридом

Можете посмотреть в сторону www.openstreetmap.org , там насколько я помню есть возможность получать все объекты в векторном виде, но придется заморачиваться со своим визуализатором.

Вам нужен Geography Subscriptions

curl -F 'client_id=CLIENT-ID' \
     -F 'client_secret=CLIENT-SECRET' \
     -F 'object=geography' \
     -F 'aspect=media' \
     -F 'lat=35.657872' \
     -F 'lng=139.70232' \
     -F 'radius=1000' \
     -F 'callback_url=http://YOUR-CALLBACK/URL' \
     https://api.instagram.com/v1/subscriptions/

instagram.com/developer/realtime

Указываете координаты всех ваших памятников с неким радиусом, ждете.

на td этой таблицы, повесить событие onclick
в функции this - будет как раз ссылкой на td
берем его innerHTML ну и пишем куда надо.

код лень писать )

Выше все в принципе написали, но распишу чуть подробней:
Смотрите как все происходит:
PHP исполняется на сервере. (в вашем случае сервер это ваш компьютер но это не важно)
PHP генерирует HTML код, который отправляется в браузер пользователя и исполняется в браузере.

Т.е вы должны в php сгенерировать валидную html страницу с подключениями js файлов итд итп.

По большому счету Вам лучше начать с основ html ru.wikipedia.org/wiki/HTML , научиться верстать, разобраться с какими то основами JS, а потом уже смотреть на php

1. Вы не можете из php/js узнать полный путь к файлу на диске на компьютере пользователя.
Вы можете только получить сам файл (при отправке формы) и его название.
*В принципе можно получить контент файла, но опять же ничего кроме кроме отправки его к вам на сервер вы не сделаете. ( www.html5rocks.com/ru/tutorials/file/dndfiles )

2. Вы не можете из php/js записать файл на компьютер к пользователю по определенному пути.
Вы можете только инициировать загрузку файла пользователем, а он уже сам выберет куда сохранить.

/([а-яё]+)/iu

Не понимаю зачем использовать сторонние модули, когда есть отличные апи с примерами:

api.yandex.ru/maps (пример с метками api.yandex.ru/maps/jsbox/2.1/balloon_ajax )
https://developers.google.com/maps/?hl=ru
api.2gis.ru/doc/maps/quickstart

Субъективно для РФ лучше карта Яндекса, для мира - Google.

У яндекса/гугла своё решение.
2ГИС использует leafletjs.com который отлично подойдет и Вам.

Сайтов без анимаций, ajax вызовов, всплывающих окон итд практически не осталось, а всё это гораздо удобней делать на jQuery чем без него.

В рамках чистого http протокола такое сделать нельзя.
Можно на js создавать в цикле iframe, в каждом скачка файла.
Будут нюансы в некоторых браузерах, мы это делали давно, некоторые браузеры выкидывали предупреждение. Как сейчас дела обстоят предлагаю проверить самостоятельно)

А вообще если пользователь хочет скачать много файлов - надо отдавать zip, это гораздо удобней для пользователя, чем выбирать куда сохранить каждый из 10 файлов

Я думаю что это наследие php программистов которые пишут js код.
В php любая переменная должна начинаться с $, соответственно некоторые когда пишут js - именуют их так же для единообразия.
У самого js требований на именование переменных нет.
Jquery выбрали символ $ для обозначение своего объекта просто так.

С учетом того что событие "клик по меню" будет происходить достаточно часто - это ощутимая нагрузка на базу. Я бы попробовал подключить яндекс.метрику с опцией "Отслеживание хеша в адресной строке браузера", а клике на меню - обновлять этот хеш.
Данные из яндекс.метрики можно забрать через апи.

Вариант более сложен в реализации чем свой счетчик, но гораздо более надежен.