FineReader после сканирования документа вызывает системный браузер для того, чтобы отобразить отсканированный документ в формате .pdf
Помимо уже сделанного, Вам нужно деинсталлировать все браузеры в системе, а также переопределить программы, с помощью которых открываются файлы определённых форматов (которые открываются браузерами).