в линухе ограничивать скорость копирования умеет scp и rsync
соотвестенно
scp -l limit Limits the used bandwidth, specified in Kbit/s.
rsync
--bwlimit=RATE
This option allows you to specify the maximum transfer rate for the data sent over the socket, specified in units per second. The RATE value can be suffixed with a string to indicate a size multiplier, and may be a fractional value (e.g. "--bwlimit=1.5m"). If no suffix is specified, the value will be assumed to be in units of 1024 bytes (as if "K" or "KiB" had been appended). See the --max-size option for a description of all the available suffixes. A value of zero specifies no limit.
UPDATE users SET amount = 123456 WHERE условие;
Где условие задать такое, чтобы под него попадали все строки, которые нужно изменить, но не попали те строки, которые менять не нужно.