Андрей Буров

nginx+php-fpm
Сколько потянет можно узнать только с помощью тестирования. Заранее подсчитать невозможно.

nice -n 15 your command here

proxyPort="443"
укажите 8080

Делайте лучше на поддоменах, т.к. если на сайте используются абсолютные пути -- ничего работать нормально не будет. +будут проблемы с cookies и т.п.

А так просто создавайте директории site1, site2 и т.п и кладите туда скрипты. Дополнительно настраивать ничего не нужно.

location /404forever {
return 404;
}

Официальный конфиг. docs.joomla.org/Nginx
добавьте last в rewrite:
rewrite ^(.*)$ /index.php last;

а посмотрите dmesg может процессы FPM падают…

location ~* ^/.*/app/ { deny all; }
вроде так

Как-то так:

location /getfile {
  try_files $arg_dir/$arg_name @genfile;
}
locaiton @genfile {
  ......
}

и в @genfile отдавать новый файл с помощью X-Accel-Redirect
Если имя в base64, то в @genfile можно декодировать и опять же послать с помощью X-Accel-Redirect

у Вас есть еще секции Server?

server_name lolhost;

добавьте

root /var/www/$var;

Откуда у Вас берется $var?

Как и писали выше делайте FastCGI.
Если будете использовать perl, учтите что в этом скрипте не должно быть блокирующих операций.

уберите ?$uri или используйте $args

location умеет регулярные выражения, можно всё «отпарсить» и подставить куда нужно