В чем проблема не понятно - есть же масса услуг хостингов для бекапов. Стоят копейки, доступы самые разные. А хранить бекапы на одном сервере с сайтом - это как защищать дом от пожара промасленной ветошью.
Вы какой-то не тот интернет "облазили". Задача давно решена, ответ ищется за три секунды: https://www.google.com/search?q=thousands+to+k+php
Но даже если предположить, что никто до вас такого не делал, то ведь это алгоритм на десять строчек...
Обычно поднимают балансировщик и делают так что сначала все ходят на 1.1.1.1.
Потом делают перевод новых сессий в новое место в пропорции 20:80.
И так далее пока все сессии не переползут.
