Потенциальная проблема, которая может возникнуть при таком обдуве - его неравномерность, т.е. например ситуация когда сильно греющаяся деталь на плате оказывается в зоне аэродинамической тени, т.к. над ней нет вентиляционных отверстий - а детали рядом и главное сама плата хорошо охлаждаются. В этом случает современная многослойная плата может не выдержать, за счет неравномерного теплового расширения платы может повредится часть дорожек. Если делаете принудительное охлаждение - оно должно быть равномерным, т.е. - снимайте корпус как минимум.
Второй момент - на охлаждаемой плате за счет значительного возрастания проходящего рядом воздушного потока и электростатики оседает заметное количество пыли, которую нужно регулярно убирать во избежание паразитных токов и емкостей через оную.