Проблема-то может быть не в жестком диске, а в сервере. Перегревается, вирусы, фрагментация файлов?
По-честному «скорость» диска надо тестировать не на операционной системе по ощущениям, а специальной программой. Время доступа тоже, и учесть что время доступа складывается еще и с временем доступа до самого сервера, операционная система что-то там себе думает и т.д. чтобы этот весь ворох причин не влиял на итоговую оценку — их надо исключить.
А при необходимости — исправить.