Чьи клики не нужны:
const selector = '.tr-class input[type="checkbox"]';
Можно добавить нежелательным элементам обработчик, где будет останавливаться всплытие события:
document.querySelectorAll(selector).forEach(function(n) {
n.addEventListener('click', this);
}, e => e.stopPropagation());
Или, в уже существующем обработчике можно проверять, откуда событие пришло, если источник неподходящий - ничего не делать:
for (const n of document.querySelectorAll('.tr-class')) {
n.addEventListener('click', onClick);
}
function onClick(e) {
if (e.target.matches(selector)) {
return;
}
// ...
}