То есть комп заражён? Прогоните 2-4 разных антивируса.
Что касается флешек в публичном месте, то это односторонний бизнес:
0) Отключите все возможные автозапуски со сторонних дисков;
1) Скопировали а флешку документ, копию оставили себе;
2) Распечатали документ, взяли бумагу;
3) Флешку при возвращении в комп сразу отформатировать, без вопросов.