1)
проблема на Хостинге. Возможно у них сервер слабый, может есть смысл на другой Хостинг перейти;
Уточните у хостера какой используется диск SSD или HDD. А если хорошая посещаемость у сайта, то нужен сервер, а не хостинг.
2)
в корневой папке сайта есть файлы, которые весят 15+ Гб. Могла ли быть задержка загрузки сайта из-за этого? Сам сайт весом ~30 Мб;
Как самый банальный вариант - удалите временно эти файлы и проверьте работоспособность сайта, так и определитесь с этим вариантом. В нём была причина или нет.
3)
в CMS много установленных модулей (большая часть работает), может из-за них проблема;
Есть сайты, которые показывают загрузку(их скорость) конкретный модулей. Попробуйте проверить. Банально можно глянуть через любой браузер загрузку того или иного элемента на сайте - панель разработчика поможет Вам в этом, а точнее веб-консоль.
4)
проблема со скриптами JS, долго загружаются;
Для начала попробуйте их сжать. Чаще всего оптимизация помогает.
5)
на сайте работает Яндекс.Метрика, думаю влияет на загрузку сайта.
Сомневаюсь, но опять таки, веб-консоль вам это подскажет.
