Я так понимаю, что ты его уже вытащил? А что за энкодер? Если найдёшь на нём маркировку, то сможешь загуглить на него даташит.
После правильного подключения вопрос уже будет состоять в том, как посчитать количество импульсов.
1. Есть разных типов. В принципе я не буду удивлён, если в какой-то дорогой мышке будет оптический или магнитный энкодер. Тогда как в дешёвых идут простые механические.
2. Есть с разной распиновкой - тупо нужно по разному подключать.