Ошибка вот здесь
$(document).ready(function(){
let myCustomClass = new MyCustomClass();
})
переменная myCustomClass объявлена в контексте функции и не доступна за её пределами, а код в обработчике onclick="myCustomClass.myCustomMethod()" ожидает, что это будет глобальная переменная.
Чтобы поправить ошибку, достаточно объявить переменную вот так:
// без document.ready
window.myCustomClass = new MyCustomClass();
Но это будет
НЕ правильным решением, потому что:
1. Не нужно смешивать разметку и код, обработчик на onclick нужно вешать через js
2. Не нужно использовать глобальные переменные, в больших проектах это чревато багами
3. Если используете JQuery, то делайте всё через него, не смешивайте разные подходы.
Воспользуйтесь кодом в примерах от
Uneasy Hearts Weigh the Most