НоваяНоменклатура.Склад = Справочники.СтруктурныеЕдиницы.ОсновнойСклад;
// В Справочнике нужный склад уже должен присутствовать
НужныйСклад = Справочники.СтруктурныеЕдиницы.НайтиПоНаименованию("Нужный склад", Истина);
НоваяНоменклатура.Склад = НужныйСклад;