1) Добавьте поле id, неудобно же без уникального идентификатора работать
2) Версия MySql должна быть достаточно свежей и поддерживать оконный функции
Предварительно забэкапьтесь
DELETE FROM guild_users
WHERE id
NOT IN
(
SELECT id
FROM
(
SELECT id,
ROW_NUMBER(PARTITION BY user_id, user_money, user_description, user_xp, lastMessage, user_warns, user_warn_reasons, user_private_role, user_exception, Time, strTime, startTime, endTime, user_timelvl, user_timexp ORDER BY user_lvl DESC) AS rn
FROM guild_users
) AS t1
WHERE rn = 1
)