Никита Кудрин, что значит запускать? Запустить = создать процесс. Что значит не модуль? Любой JS файл в ноде является модулем.
Три варианта исполнения кода:
1. Вы можете динамически через require подключить файл. Его исходный код будет в любом случае исполнен, а все, что указано через экспорт - доступно вне этого файла.
2. Запускать отдельные процессы.
3. Thread workers