Как написано - так и работает.
Вот, например, правило:
-A POSTROUTING -s 10.1.3.0/24 -o br0 -j SNAT --to-source 192.168.11.3
Оно должно подменять source у пакетов, прилетевших с адресов 10.1.3.0/24 на выходе в интерфейс br0. Однако если мы пингуем 192.168.1.72, обратно пакеты приходят с адреса 192.168.1.72 и нигде не подменяются на 10.1.3.0/24. А, собственно, зачем их подменять?
Решать задачу надо иначе. Надо или сделать SNAT (MASQUERADE) на 192.168.1.44 с адресов не только 10.1.3.0/24, но и 192.168.11.0/24 (в этом случае в wg-туннеле будут ходить адреса 192.168.11.0/24):
192.168.1.44:
-A POSTROUTING -s 10.1.3.0/24 -o enp4s0 -j MASQUERADE
-A POSTROUTING -s 192.168.11.0/24 -o enp4s0 -j MASQUERADE
Либо надо на 192.168.11.3 делать подмену в туннельные адреса, которые в свою очередь заменяются в местный IP уже на "той" стороне (в этом случае в туннеле будут ходить только адреса 10.1.3.0/24):
192.168.11.3:
-A POSTROUTING -o wg0 -j MASQUERADE
192.168.1.44:
-A POSTROUTING -s 10.1.3.0/24 -o enp4s0 -j MASQUERADE