Добрый день!
Такая проблема: у меня стоит Ubuntu 12.10 и в некоторых приложениях ( напр IDEA) не работают shortcut содержащие ctrl или shift. Даже Ctrl+Z не сделать. Но в gedit все нормально работает.
@cska63 Странно, у меня в GNOME 3 и Ubuntu 13.10/14.04 такая фигня. Работает на английской раскладке, или в Gedit, Firefox, но не в PhpStorm при прочих.