Как не принимать нежелательные файлы когда автор принимает pull-request?
1) Я форкнул проект. Сделал исправления, создал pull-request.
2) автор проекта, после моего форка создал дополнительную папку в проекте.
3) автор принял pull-request. все ок без конфликтов.
4) у меня в репозитории не появились новые папки и файлы, добавленные автором после моего форка (что хорошо)
5) я сделал новый pull-request. Были конфликты
6) автор разрешил конфликты сам и принял pull-request. Как следствие обновился и master в моем репозитории и у меня появились те папки и файлы, что были добавлены автором ранее
Вопрос: как не принимать нежелательные папки и файлы в таком случае?
Если отсутствие новой папки нужно не только вам, а обусловлено какой-то логикой, то вы можете договориться с автором оригинального репа о создании дополнительной ветки без этой папки, использовать эту ветку и делать PR в нее.