В общем, решил вопрос изменением добавления камеры к сцене (все посредствами babylonjs).
Заменил добавление камеры с:
camera.attachControl(canvas, true);
На:
camera.attachControl(canvas);
И теперь при наведенном курсоре на канвас масштабируется сцена, а в него его происходит прокрутка страницы.
Буду дальше разбираться в устройстве babylon js)