сразу создавать массив запросом. результат которого выгрузить в ТЗ, свернуть ТЗ а затем из ТЗ выгрузить колонку
ТЗ = РезультатЗапроса.Выполнить().Выгрузить();
ТЗ.Свернуть(Номенклатура);
МассивУникальныхНоменклатурныхПозиций = ТЗ.ВыгрузитьКолонку("Номенклатура");