Данным ничего не будет.
Но прочитать дедуплицированные данные на windows 10 вы не сможете.
Файлы и каталоги будут видны, будут корректно отображаться, те что не дедуплицированы будут нормально читаться, а вот дедуплицированные не прочитаются.
Переставите обратно на сервер с включенной службой дедупликации - и будете работать дальше.
Можно и на Windows 10 при большом желании внедрить дедупликацию, но это нарушение лицензии.
