Легко можно найти 2 файла, если хватает места для третьей копии. Копируете все отсортированные в одну новую папку. Сравниваете тупо 1-ю папку с 3-й. Это удобно делать в FAR manager, но можно сделать и голыми руками методом дихотомии. Если считать, что на последнем шаге можно без труда визуально найти один из 16 файлов, то будет достаточно 10 сравнений, чтобы найти 1 потерянный среди 16384 файлов. Два потерянных - за 20 сравнений, только с использованием рук и глаз, без утилит, без написания скриптов.
