Имею 3 VPS с выделенными IP адресами. Нужно к первому IP привязать ns1.site.ru, ко второму ns2.site.ru, а к третьему основной домен.
Как осуществить данную затею?
Пропишите NS-ы домена site.ru вместе с IP адресами у вашего регистратора.
На каждом ns-поднимаете bind и настраиваете нужные зоны.
"Основному домену" просто указывайте новые ns-ы.